La palabra “HUAMBOYA” proviene de dos vocablos de la vieja lengua Shuar que significa:
La Parroquia Huamboya se fundó como Pre-Cooperativa en forma oficial el 24 de Mayo de 1970, perteneciente a la parroquia Arapicos, cantón Palora, provincia de Morona Santiago, está situada aproximadamente a 45 kilómetros de la ciudad de Macas y a unos 80 Km. de la ciudad del Puyo, ciudades que cumplen un importante papel como centros de comercialización y consumo.
El creciente progreso, dentro del campo agrícola y pecuario que venía experimentando Huamboya, hasta 1990, no estaba marchando paralelo al aspecto educativo. Por lo que las fuerzas vivas de Huamboya iban formando ideas de que era el momento de emprender la lucha por nuestros derechos y que se debía realizar gestiones para la creación de un centro de enseñanza a nivel medio y especialmente el Proyecto de Cantonización de la parroquia Huamboya.
El 14 de Julio de 1990 se contacta en la ciudad de Quito con el Señor Herminio Álvarez Presidente de Azuayos Residentes en Quito, a quien lo comprometen para que sea la persona encargada de realizar toda la tramitación a favor de la creación del cantón Huamboya.
El 11 de Diciembre de 1991 mediante oficio No. 0311-PCN-91 el Dr. Manuel Salgado Tamayo comunica al Sr. Dr. Rodrigo Borja C. Presidente de la República, la aprobación del Proyecto de Ley de Creación del Cantón Huamboya.
Y es así que el 26 de Diciembre de 1991 el Plenario de las Comisiones Legislativas en ejercicio de las facultades constitucionales, expide la Ley de Creación del Cantón Huamboya en la provincia de Morona Santiago.
El 2 de Enero de 1992 en el Registro Oficial No 844 el Plenario de las comisiones Legislativas promulgan la Ley de Creación del Cantón Huamboya, y la Parroquia Pablo Sexto, en la Provincia de Morona Santiago.